Пропавшая сотрудница ФБР — последняя надежда на спасение в руках бывших агентов Фокса Малдера и Даны Скалли, давно покинувших службу. Малдер, одержимый поиском сверхъестественного, и Скалли, скептик-врач, вновь оказываются втянутыми в расследование, где границы науки и веры стираются. Единственная зацепка — Джозеф Криссман, бывший священник с тёмным прошлым, утверждающий, что видит преступления «по воле Бога». Его видения ведут к шокирующей правде, заставляя героев столкнуться не только с тайной исчезновения, но и с собственными демонами. Фильм балансирует между триллером и мистикой, возвращая зрителей во вселенную «Секретных материалов» — мир паранормального и неразгаданных загадок.