На затерянном в Тихом океане острове, отравленном радиацией, местные жители веками поклонялись божеству — гигантской бабочке Мотре и её священному яйцу, из которого должна была родиться новая защитница. Но тайфун разрушил их мир, унеся яйцо в открытое море. Оно прибилось к берегам Японии, где его обнаружили рыбаки. Вскоре реликвия оказалась в руках алчной корпорации, превратившей её в развлечение для толп туристов. Мотра, сопровождаемая двумя крошечными феями-хранительницами, умоляла людей вернуть яйцо, но тщетно. Однако когда Годзилла снова поднялся из глубин, сея хаос и разрушение, человечество осознало свою ошибку. Теперь только Мотра могла остановить древнего монстра — но согласится ли она защитить тех, кто предал её доверие? В этом эпическом противостоянии двух титанов решается судьба не только Японии, но и хрупкого баланса между людьми и древними силами природы.