В 2013 году отряд G.I. Joe снова оказывается на передовой борьбы с террористической организацией «Кобра». После того как их репутация оказывается под угрозой из-за обвинений со стороны правительства, элитные бойцы вынуждены действовать в тени, чтобы раскрыть заговор и восстановить своё имя. В ходе опасной миссии им предстоит столкнуться с новыми технологиями, предательством и смертоносными противниками, включая загадочного лидера «Кобры», чьи планы угрожают глобальной безопасности. Сражаясь против всех odds, команда демонстрирует беспрецедентную смелость и сплочённость, доказывая, что даже под давлением они остаются последней линией обороны мира от хаоса.