Десять лет спустя после битвы за Набу Галактическая Республика балансирует на грани распада. Сепаратисты, объединившие сотни миров и корпораций, бросают вызов власти Сената, а джедаи, хранители мира, не в силах предотвратить надвигающуюся катастрофу. За кулисами политических интриг таинственный Дарт Сидиус манипулирует событиями, разжигая конфликт, который приведёт к Клоническим войнам. На фоне всеобщего хаоса рыцарь-джедай Энакин Скайуокер, теперь уже подмастерье Оби-Вана Кеноби, сталкивается с испытаниями: его охватывают тёмные предчувствия о судьбе матери и запретная любовь к сенатору Падме Амидале. Когда попытка убийства Падме раскрывает заговор сепаратистов, джедаи отправляются в опасное расследование, ведущее их к таинственной планете Камино — месту создания армии клонов. Республика стоит на пороге войны, а Энакин — на краю своей судьбы.