1950-е годы. Астроном Дж. Аллен Хинек и капитан ВВС США Майкл Квинн продолжают расследовать загадочные случаи появления НЛО, сталкиваясь с новыми необъяснимыми явлениями и свидетельствами. Во втором сезоне «Проекта „Синяя книга“» их поиски правды приводят к ещё более опасным открытиям: правительственные агенты усиливают давление, скрывая шокирующие факты о внеземных контактах. По мере погружения в тайны военных архивов герои обнаруживают, что заговор гораздо глубже, чем казалось, а некоторые встречи с неопознанными объектами могут изменить ход истории. С каждым шагом Хинек и Квинн балансируют на грани между научной истиной и смертельной угрозой, пытаясь докопаться до секретов, которые власти готовы защищать любой ценой.